吉林省教育厅水资源与水环境重点实验室的前身是1994年成立的原地质矿产部“水资源评价与管理系列模型”开放研究实验室，于2006年由吉林省教育厅批准建设。实验室聚焦水资源与水环境，重点开展水资源开发利用、水环境中污染物的环境行为与效应、水污染控制与修复等领域的基础理论和应用技术研究，并成为水资源与水环境领域省内顶尖、国内一流、国际上有重要影响的研究中心和高层次人才培养基地。实验室的研究工作以地下水资源利用与污染控制、地下新能源开发利用中的渗流和水环境问题、寒区和冰雪环境中的水资源与水环境问题等的研究为鲜明特色，围绕吉林省和国家科技需求，致力于解决水资源和水环境领域重大基础理论问题与技术难题，服务“美丽中国”和“生态文明建设”。实验室拥有一支高水平的科研队伍，现有专职研究人员90余人，其中包括中国科学院院士1人、国家级高层次人才4人、国家级青年人才3人、其他各类人才30余人。实验室现有各类实验室近4000 m²，各类先进仪器设备5000余万元。近年来，实验室得到了长足发展，取得了一系列重要成果。其中近5年来承担国家重点研发计划专项项目4项、课题9项，自然科学基金重点/专项项目7项，总到款经费3亿余元；获省部级科研奖励11项、发表高水平学术论文1000余篇、授权发明专利50余项、出版专著8部。